#Covid19 🦠 #HIV 🦠 #LucMontagnier 👨🏻🎓🏆 #Pfizer 💉 #vaccine_acquired_immunodeficiency_syndrome 🤒 #VAIDS 😷 #AIDS 🤕 #کووید۱۹ ، #لوکمونتاگنیر #اچآیوی #ایدز #سندرومنقصایمنیناشیازواکسن . در این رشتو میخوام این فرضیه که آیا ویروس کوید ۱۹ که از ووهان بیرون آمد و در دنیا گسترش یافت مهندسی شده بوده یا نه رو طی سه مرحله بررسی کنیم و بعد توضیح بدیم که این چه ارتباطی با واکسن فایزر میتونه داشته باشه و چطوری میشه `توربوکنسر` یا نرخ بالای سرطانزایی بعد از دریافت واکسن و یا VAIDS یا سندروم نقص ایمنی ناشی از واکسن رو توضیح داد. . داستان رو از یک زیستشناس فرانسوی به نام لوک مونتاگنیر شروع میکنیم. مونتاگنیر کاشف ویروس HIV هست و تونست برای اولین بار این این ویروس رو از غدد لنفاوی بیماران مبتلا به AIDS یاAcquired immunodeficiency syndrome جداسازی و تخلیص کنه. در ادامه ایشون مقالات زیادی روی توالی و ساختار ژنوم ویروس و پروتئینهای ویروس HIV داره و مکانیسم های عملکردش داره و بیش از بیست سال روی این ویروس کار کرده. مونتاگنیر بخاطر این کارهای ارزشمندش در سال ۲۰۰۸ جایزه نوبل فیزیولوژی و پزشکی رو دریافت میکنه! لذا این رو قبول کنید که اگر مونتاگنیر حرفی که میزنه رو تا عمق مناسبی میفهمه! . حالا این آقای مونتاگنیر بعد از انتشار کروناویروس یک حرفی میزنه که بنظر من خیلی عجیب اومد!🧐 رسانه ها نوشته بودند مونتاگنیر میگه ویروس کرونا از ویروس HIV مشتق شده!🤨 بعد هم کلی حمله بهش که نه تو اشتباه میگی و همچین چیزی ممکن نیست! لذا با توجه به اینکه این دو ویروس خیلی از لحاظ فامیلی از هم فاصله دارند و هم تیتر رسانه ها خیلی زرد بنظرم رسید،🤨 ولی از طرف دیگه مونتاگنیر رو آدم باسوادی میدیدم که حرف الکی نمیزنه🤨 رفتم روی این قضیه تحقیق کنم و به یک مقاله ای رسیدم که withdraw شده یعنی حذف شده، ولی چون کار مقاله یک آنالیز کامپیوتری ساده هست میتونیم با هم اون رو اینجا تکرار کنیم و ببینیم چرا مونتاگنیر معتقد بود یک مهندس ژنیتیک مثل یک ساعت ساز این ویروس رو طراحی کرده. با من همراه باشید . ۱/👇🏻🧶°°°🐈
اون مقاله ای که راجع به ارتباط ویروس HIV و کوید۱۹ صحبت میکنه و بعد حذفش کردند اینه👇🏻 . (ما میخوایم این مقاله رو بخونیم و قدم به قدم تکرارش کنیم ببینیم راست میگه یا نه) . خلاصه کارشون که تو مقدمه گفته اینه: . " ۱/ ما چهارتا insert یا توالی اضافه شده (که اون رو با ➕نشون خواهم داد) در گلیکوپروتئین اسپایک ویروس کرونا (S) پیدا کردیم که در منحصرا و فقط در کرونا ویروسی که از ووهان منتشر شد وجود داره و در هیچ کرونا ویروس دیگه ای مشاهده نمیشه (دقت کنید خانواده ی ویروسهای کرونا خانواده ی بزرگی هست که شامل سارس SARS و MERS و ... میشه) . ۲/ توالی آمینواسیدی این insert ها با توالی آمینواسیدی قطعاتی در پروتئین Gag120 متعلق به ویروس HIV-1 دارای تشابه یا یکسانی هست. (دقت کنید دو واژه identity و similarity با هم متفاوت اند، وقتی میگیم دو توالی پروتئین با هم identity دارند یعنی تشابه ۱۰۰٪ و عینا کپی هم هستند، ولی similarity یعنی مشابه اند و متفاوت اندک قابل اندازه گیری)(حالا از این ۴ تا insert دو تاش کاملا بین دو ویروس یکسان اند یعنی identity داریم، و دو تای دیگرش یک gap دارند پس similarity داریم) . ۳/با وجود اینکه این insert ها در توالی خطی آمینواسیدی با هم فاصله دارند، اما وقتی ساختار پروتئین رو 3D modelling میکنیم و بطور سه بعدی نگاه میکنیم، همه این توالی ها که از HIV مشتق شدند کنار هم قرار میگیرند و دقیقا محل اتصال به گیرنده سطح سلول هستند!!!!!! " . این سه تا ادعایی هست که مقاله کرده! اول با هم تکرارش کنیم، بعد ببینیم چه معنی ای داره، و بعد به این سوال جواب بدیم که چرا ویروس HIV و این چه ربطی میتونه به توربوکنسر داشته باشه، اما قبل از اون برای اینکه شماتیک کلی نتیجهی نهایی ای که قراره بگیریم رو بفهمید براتون یک نقاشی کشیدم🖌️🎨: تو شکل 1️⃣ یک نحوه ی اتصال و ورود ویروس HIV به سلولهای ایمنی CD4+ رو میبینید. نحوهی ورود اینه که یک پروتئینی وجود داره روی سطح ویروس HIV به اسم Gag120 این پروتئین از لحاظ ساختار فضایی و 3D مکمل یک پروتئین دیگه ای هست به اسم CD4 (که با بنفش 🟣نشون دادم) که این CD4 روی سطح دسته خاصی از سلولهای ایمنی به اسم سلولهای CD4 مثبت وجود داره. نکته ی مهم در این اتصال اینه که ۴ تا قطعه آمینواسیدی که با رنگ قرمز نشون دادم 🔴دقیقا توالی هایی هستند که بین Gag120 و CD4 اتصال برقرار میکنند. . در شکل 2️⃣ ویروسهای خانواده کرونا رو میبینید که یک پروتئین دارند روی سطحشون به اسم اسپایک S ( آبی🔵) که وصل میشه به گیرنده ی ACE2 (سبز🟢) که روی سطح سلولهای ریه و قلب و ...وجود داره . ورود ویروسها به سلولها اختصاصی هست و با واسطه اتصال پروئین اسپایک به گیرنده اش انجام میشه، بنابراین: HIV)🔴-🟣(CD4+ cell SARS)🔵-🟢(ACE2+ cell بنابراین ویروس HIV با داشتن اسپایک🔴وارد سلولهای CD4+ ایمنی میشه و ویروسهای خانواده کرونا با داشتن اسپایک S 🔵وارد سلولهایی که گیرنده ACE2 🟢 رو دارند میشه (مثل سلولهای ریه و قلب و ..) . حالا تو شکل 3️⃣تا 5️⃣ میبینید که دقیقا چهار توالی مهم در اتصال HIV به گیرنده اش رو بریدیم 🔴🔴🔴🔴✂️ و طوری این چهار insert رو به این رو به اسپایک کرونا اضافه کردیم که ساختار فضایی حفض بشه. اما وقتی به توالی خطی قبل از تا خوردن پروتئین نگاه کنیم، این توالی ها با هم فاصله دارند.6️⃣ . (این به ما چی میگه؟ نتیجه ای که یک فلوکی میتونه بگیره اینه که ویروسی که مهندسی شده تا این چهارتا insert رو داشته باشه، علاوه بر توانایی ورود به سلولهای ACE2+ مثل سلولهای ریه، توانایی ورود به سلولهای CD4+ ایمنی رو هم پیدا خواهد کرد، این رو اینجا نگه دارید بهش برمیگردم) . حالا بیایم مراحل فهمیدن این مهندسی ژنتیک رو پیش بریم: ۲/🧶🐈👇🏻
اما مراحلی که باید انجام بدهیم تا اینارو بفهمیم سه مرحله است: ۱/ ❓از کجا فهمیدیم این چهار تا insert ها وجود دارند و فقط در ویروس Covid19 منتشر شده از ووهان وجود دارند و نه در هیچ کرونا ویروس دیگه ای؟ . جواب: اول اینکه تمام ژنومهای کوید۱۹ ای که تا امروز توالییابی شدند در این دیتابیس ذخیره شدند و همه میتونید برید توالی هارو نگاه کنید(تا قبل از اینکه سانسورچی توالی هارو سانسور کنه و کلا سایت رو تعطیل کنه😏): . ncbi.nlm.nih.gov/labs/virus/vss… توالی رفرنس ای که استفاده میکنیم این هست (اگر سایت باز بشه) این توالی رو باید با فرمت FASTA دانلود کنید ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_045… . اما چون احتمال داره سایت باز نشه من در ادامه خودم توالی هارو میگذارم و دستی میریم جلو: 👇🏻🧶🐈
این توالی گلیکوپروتئین کوید ۱۹ هست، لطفاً عین این رو کپی کنید . >YP_009724390.1 surface glycoprotein [Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2] MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHV SGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPF LGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPI NLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYN ENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASV YAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIAD YNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYF PLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFL PFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLT PTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLG AENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGI AVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDC LGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIG VTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDI LSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLM SFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNT FVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVA KNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDD SEPVLKGVKLHYT
این هم توالی پروتئین اسپایک سارس مهندسی نشده هست(قبل از اینکه insert ها بهش اضافه بشه) لطفاً این رو هم عسنا کپی کنید >AAS00003.1 spike glycoprotein [SARS coronavirus GZ02] MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFH TINHTFDNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAV SKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLP SGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFLPAQDTWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQ NPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSRDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKRISNCVA DYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCV LAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIG YQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTD SVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQ TQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNF SISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQM YKTPTLKDFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGL TVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFN KAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLIT GRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYV PSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVY DPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQEEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQ YIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT
حالا برید این دو تا توالی رو پرت کنید در این سایت تا با هم مقایسه کنه و insert هارو به شما نشون بده: genome.jp/tools-bin/clus… . یک همچین جوابی به شما میده👇🏻: میبینید که در دو توالی یک جاهایی gap هست، مثلا توالی آمینواسیدی TNGTKR جدیده و به ژنوم کوید۱۹ ووهان اضافه شده (در واقع این توالی insert-1 هست) . (دقت کنید این عین روش مقاله نیست، عین مقاله رو بعدا میگذارم، این برای اینه که خودتون امتحان کنید و ببینید) . حالا در مرحله ی بعدی میخوایم ببینیم این توالی TNGTKR از کجا اومده (فرض کنید هنوز نمیدونیم از HIV اومده) . 👇🏻🧶🐈
در مرحله بعدی برید در این سایت blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi و روی protein blast کلیک کنید. کار این سایت local seq alignment هست یعنی میتونه توالی های کوچک (لوکال) پروتئین رو علیه دیتابیس ژنوم تمام ویروسهایی که تا امروز کشف شده جستجو کنه و بفهمه این توالی از کجا اومده . وارد سایت که شدید در قسمت توالی بنویسید:(این در واقع توالی ای هست که میخوایم در ژنوم تمام ویروسها سرچ کنیم) >insert -1 TNGTKR در قسمت ارگانیسم انتخاب کنید تمام ویروسها Viruses(taxid:10239) برای اینکه ویروسهای ووهان رو پیدا نکنه و تکراری نباشه، در خط بعدی کرونا ویروس ووهان رو اضافه کنید و اون رو exclude کنید که توی ژنوم اون نگاه نکنه Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (taxid:2697049). ✔️ exclude بعد blast رو بزنید. یک همچین جوابی میگیرید که در عکس زیر نشون دادم و نشون میده که عین این توالی در ژنوم ویروس HIV-1 هم وجود داره!!!